MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017810	TCC	2	6	1	6	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858955
2	NC_017810	CAT	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858955
3	NC_017810	CTC	3	9	43	51	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858955
4	NC_017810	CAC	2	6	94	99	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858955
5	NC_017810	CAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858955
6	NC_017810	TGT	2	6	149	154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
7	NC_017810	ATA	2	6	166	171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
8	NC_017810	AGTT	2	8	328	335	25 %	50 %	25 %	0 %	386858955
9	NC_017810	TGCTGG	3	18	395	412	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386858955
10	NC_017810	TGC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
11	NC_017810	TAA	2	6	431	436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
12	NC_017810	A	6	6	510	515	100 %	0 %	0 %	0 %	386858955
13	NC_017810	TGG	2	6	539	544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858955
14	NC_017810	CTG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
15	NC_017810	TTG	2	6	568	573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
16	NC_017810	TGC	3	9	584	592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
17	NC_017810	TGAT	2	8	655	662	25 %	50 %	25 %	0 %	386858955
18	NC_017810	TAA	2	6	710	715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
19	NC_017810	TACTGG	2	12	734	745	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386858955
20	NC_017810	AGC	3	9	782	790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858955
21	NC_017810	TGC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
22	NC_017810	AGC	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858955
23	NC_017810	TAA	2	6	907	912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
24	NC_017810	AGTA	2	8	923	930	50 %	25 %	25 %	0 %	386858955
25	NC_017810	GTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858955
26	NC_017810	TGT	2	6	1022	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
27	NC_017810	TAAA	2	8	1031	1038	75 %	25 %	0 %	0 %	386858955
28	NC_017810	AT	3	6	1332	1337	50 %	50 %	0 %	0 %	386858956
29	NC_017810	TAA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858956
30	NC_017810	TGC	3	9	1402	1410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858956
31	NC_017810	ACT	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858956
32	NC_017810	AAAG	2	8	1471	1478	75 %	0 %	25 %	0 %	386858956
33	NC_017810	AGC	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858956
34	NC_017810	GAT	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858956
35	NC_017810	AGC	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858956
36	NC_017810	AGTA	2	8	1600	1607	50 %	25 %	25 %	0 %	386858956
37	NC_017810	TGA	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858956
38	NC_017810	G	6	6	1681	1686	0 %	0 %	100 %	0 %	386858956
39	NC_017810	AGTT	2	8	1774	1781	25 %	50 %	25 %	0 %	386858957
40	NC_017810	CT	3	6	1798	1803	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
41	NC_017810	T	6	6	1803	1808	0 %	100 %	0 %	0 %	386858957
42	NC_017810	TA	3	6	1819	1824	50 %	50 %	0 %	0 %	386858957
43	NC_017810	T	6	6	1841	1846	0 %	100 %	0 %	0 %	386858957
44	NC_017810	A	7	7	1874	1880	100 %	0 %	0 %	0 %	386858957
45	NC_017810	ATA	2	6	1884	1889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858957
46	NC_017810	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858957
47	NC_017810	AGG	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858957
48	NC_017810	ATA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858957
49	NC_017810	GAGAA	2	10	1932	1941	60 %	0 %	40 %	0 %	386858957
50	NC_017810	AGGAG	2	10	1966	1975	40 %	0 %	60 %	0 %	386858957
51	NC_017810	AG	3	6	1974	1979	50 %	0 %	50 %	0 %	386858957
52	NC_017810	AG	3	6	1982	1987	50 %	0 %	50 %	0 %	386858957
53	NC_017810	GAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858957
54	NC_017810	CAA	2	6	2017	2022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858957
55	NC_017810	A	6	6	2064	2069	100 %	0 %	0 %	0 %	386858957
56	NC_017810	TTC	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858957
57	NC_017810	CTC	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858957
58	NC_017810	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858957
59	NC_017810	CACCAT	2	12	2144	2155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858957
60	NC_017810	TC	3	6	2188	2193	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
61	NC_017810	CT	3	6	2194	2199	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
62	NC_017810	CT	4	8	2203	2210	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
63	NC_017810	TC	3	6	2214	2219	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
64	NC_017810	CT	4	8	2234	2241	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
65	NC_017810	ATT	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
66	NC_017810	CTG	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858958
67	NC_017810	AGC	3	9	2945	2953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858958
68	NC_017810	TGC	3	9	2993	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858958
69	NC_017810	TTA	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
70	NC_017810	TAG	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858958
71	NC_017810	ATT	3	9	3068	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
72	NC_017810	CAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858958
73	NC_017810	ATCA	2	8	3116	3123	50 %	25 %	0 %	25 %	386858958
74	NC_017810	ACC	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858959
75	NC_017810	TAATCT	2	12	3300	3311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858959
76	NC_017810	CAG	2	6	3342	3347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858959
77	NC_017810	GCA	5	15	3353	3367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858959
78	NC_017810	CAA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858959
79	NC_017810	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858959
80	NC_017810	AAT	2	6	3433	3438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858959
81	NC_017810	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858959
82	NC_017810	AGA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858959
83	NC_017810	TC	3	6	3583	3588	0 %	50 %	0 %	50 %	386858959
84	NC_017810	ATC	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858959
85	NC_017810	TCC	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858959
86	NC_017810	AAG	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858959
87	NC_017810	ATT	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
88	NC_017810	TCT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960
89	NC_017810	T	6	6	4165	4170	0 %	100 %	0 %	0 %	386858960
90	NC_017810	TAT	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
91	NC_017810	ATC	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
92	NC_017810	ATT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
93	NC_017810	ATCTTT	2	12	4341	4352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858960
94	NC_017810	CT	3	6	4375	4380	0 %	50 %	0 %	50 %	386858960
95	NC_017810	T	6	6	4380	4385	0 %	100 %	0 %	0 %	386858960
96	NC_017810	GCA	2	6	4390	4395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
97	NC_017810	CAG	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
98	NC_017810	T	6	6	4408	4413	0 %	100 %	0 %	0 %	386858960
99	NC_017810	CAG	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
100	NC_017810	TCA	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
101	NC_017810	CAC	2	6	4481	4486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858960
102	NC_017810	GCA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
103	NC_017810	CAG	3	9	4538	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
104	NC_017810	TAG	2	6	4595	4600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858960
105	NC_017810	T	6	6	4621	4626	0 %	100 %	0 %	0 %	386858960
106	NC_017810	CAC	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858960
107	NC_017810	TAA	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858960
108	NC_017810	CTGA	2	8	4697	4704	25 %	25 %	25 %	25 %	386858960
109	NC_017810	TGC	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858960
110	NC_017810	CTT	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960
111	NC_017810	AAAT	2	8	4790	4797	75 %	25 %	0 %	0 %	386858960
112	NC_017810	ACT	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
113	NC_017810	T	7	7	4834	4840	0 %	100 %	0 %	0 %	386858960
114	NC_017810	ATC	2	6	5068	5073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
115	NC_017810	ACCATC	2	12	5074	5085	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858960
116	NC_017810	TTC	2	6	5102	5107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.